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簡要描述:單細(xì)胞測序核心技術(shù):Rhapsody利用微孔進(jìn)行單細(xì)胞分離,屬于Microwell-seq。 20萬個(gè)微孔的尺寸被設(shè)計(jì)成一個(gè)微孔恰好可以容納一個(gè)bead+一個(gè)細(xì)胞。
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BD Rhapsody: 單細(xì)胞分析工作流程
1. BD Rhapsody 核心技術(shù)之微孔板
一個(gè)微孔 = 一個(gè)單細(xì)胞 + 一個(gè)磁珠
BD Rhapsody Express單細(xì)胞分析系統(tǒng)提供的單細(xì)胞分割,以微孔為基礎(chǔ),功能強(qiáng)大。
● 限度一套臺(tái)式設(shè)備,沒有射流泵
● 當(dāng)細(xì)胞在重力作用下沉入微孔時(shí),可以對(duì)其進(jìn)行溫和的處理
● 每個(gè)BD Rhapsody微孔板均包括一個(gè)超過22萬個(gè)分區(qū)的微孔陣列
● BD Rhapsody"微孔板體積約為600μL,稀釋細(xì)胞懸浮液可直接裝入微孔板,無需將其濃縮到非常小的體積
● 由于沒有微流通道,因此不需要擔(dān)心通道堵塞的問題
● 微孔經(jīng)過特殊處理,以防止細(xì)胞粘附在表面,并進(jìn)行深入的質(zhì)量控制
Rhapsody利用微孔進(jìn)行單細(xì)胞分離,屬于Microwell-seq。 20萬個(gè)微孔的尺寸被設(shè)計(jì)成一個(gè)微孔恰好可以容納一個(gè)bead+一個(gè)細(xì)胞。
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3. 單細(xì)胞文庫制備及測序
Single cell isolation and capture流程圖
4. BD Rhapsody技術(shù)優(yōu)勢(shì)
成本更低—— 靶向基因檢測,避免看家基因占用的大量測序數(shù)據(jù),大大節(jié)省了測序和分析成本。
超高細(xì)胞捕獲效率—— 有效細(xì)胞捕獲率60%,遠(yuǎn)高于市場上目前所有大通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)。
罕見轉(zhuǎn)錄本,更高檢出率—— 靶向定制panel,選定特定基因組合,提高UMI計(jì)數(shù)效率,罕見轉(zhuǎn)錄本檢測閾值更低。
克服PCR,擴(kuò)增偏差——引入單細(xì)胞測序金標(biāo)準(zhǔn),BD分子標(biāo)簽,降低非特異性表達(dá)。
實(shí)理更高的分辨率——可以分辨更精細(xì)、微觀的細(xì)胞群和細(xì)胞亞種群。
反轉(zhuǎn)錄的磁珠,超常穩(wěn)存儲(chǔ)——完整cDNA可在磁珠微球結(jié)構(gòu)保存長3月(4度),隨用隨取。
靈活分樣組合——提高樣品通量(最多可12個(gè)樣本同時(shí)建庫,可等分,可隨機(jī)組合);又可以同時(shí)進(jìn)行單細(xì)胞蛋白和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合檢測,大大降低成本的同時(shí),也為單細(xì)胞多組學(xué)研究提供了更高效的平臺(tái)。
5. BD Rhapsody產(chǎn)品線overview
單細(xì)胞測序核心技術(shù)
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